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ctDNA结合NGS在晚期胃肠间质瘤(GIST)中的临床应用研究

胃肠间质瘤(GIST)是最常见的消化道间叶肿瘤,GIST的诊断大多基于组织标本,但晚期GIST患者活检/穿刺往往会带来较大风险。血浆ctDNA液态活检具有无创、安全、灵活便捷、克服肿瘤异质性等优势,并且在肺癌、肠癌的诊断、耐药机制探索、预后等多方面广泛应用。那么ctDNA结合NGS检测在GSIT中临床应用如何呢?与组织检测的匹配度如何?

江苏省人民医院徐泽宽教授团队与世和基因回顾性研究了32例晚期GIST患者血浆ctDNA结合NGS检测的临床应用,主要从ctDNA在晚期GIST患者的诊断和疗效预测两方面进行探索。其成果于2017年11月13日发表在Molecular Cancer Therpeutics (影响因子为5.76),为血浆ctDNA液态活检在晚期GIST患者的诊断和疗效预测方面提供重要的临床指导意义。

胃肠道间质瘤(GIST)起源于Cajal间质细胞(ICC),是最常见的腹部软组织肉瘤。c-Kit和PDGFRA突变的晚期GIST患者可以从小分子激酶抑制剂(TKIs)中获益,但晚期GIST患者活检/穿刺存在较大的肿瘤播散风险。ctDNA(circulating tumor DNA)为肿瘤细胞凋亡后释放到外周血/体液中的小片段DNA,包含肿瘤特有突变,更安全、便捷。本文总计入组32例晚期GSIT,通过NGS方法同时检测组织样本和血浆ctDNA样本。

ctDNA液态活检临床中有多种检测方法,如ARMS、ddPCR、BEAMing、NGS等。本文首先比较BEAMing、PCR和NGS三种技术检测晚期GIST患者血浆ctDNA的灵敏度。结果如图1a所示,NGS方法以56.3%的检出率远高于BEAMing或PCR方法(检出率分别为16.7%和39.5%);并且当肿瘤组织>10cm时,NGS检测ctDNA的灵敏度更高(如图1b)。进一步探索ctDNA与肿瘤组织的匹配度与肿瘤大小和Ki-67表达率的相关性。结果如图1c所示,当肿瘤≥10cm时,ctDNA与肿瘤组织的匹配度高达87%!当Ki67表达>5%时,ctDNA与组织的匹配度高达89%!(如图1b)。

 

图1:NGS结合ctDNA的检出率及ctDNA与组织匹配度与肿瘤大小和Ki67表达的相关性

 

ctDNA结合NGS检测除了在晚期GIST诊断方面存在较大的优势之外,在疗效预测预后方面是否也有指导作用呢?本研究入组的32例晚期GIST患者在NGS检测之后,均用传统方法验证为KIT/PDGFRA阳性患者,其中31例(97%)的患者进行伊马替尼治疗,并对其进行跟踪随访。结合随访数据,本文将ctDNA检测的突变和病理因素如肿瘤大小、Ki67表达、有丝分裂象等一起进行生存随访分析。结果如图2所示,ctDNA检测到KIT基因11外显子突变,可以作为伊马替尼用药疗效的独立预测预后因子

 

图2:晚期GIST患者用伊马替尼的疗效影响因素

 

结语:

以上研究结果表明,NGS结合ctDNA液态活检技术在晚期GIST患者中,尤其是肿瘤大于10cm或者Ki67表达>5%的患者,具有非常高的灵敏度和组织匹配度。此外,ctDNA NGS检测到KIT第11外显子突变阳性的患者具有更好的疗效和预后。不忘初心,厚积薄发,世和基因ctDNA液态活检始于2015年2月,目前已积累几万例的各类肿瘤ctDNA液态活检数据库,我们由衷得希望能和各位专家进行更深入合作,探讨NGS检测及液态活检在临床上应用的新方向!

 

参考文献:

XuH, Chen L1, Shao Y, et al. Clinical application of circulating tumor DNA in thegenetic analysis of patients with advanced GIST. Mol Cancer Ther. 2017 Nov 13.pii: molcanther.0436.2017. doi: 10.1158/1535-7163.MCT-17-0436.

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