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Research Services

Devoted in Cancer Personalized Medicine and Next-Generation Sequencing

Geneseeq’s Chinese Headquarter is located in JiangBei New Area of Nanjing, China and North American Headquarter is located in Toronto’s MaRS Discovery District. Geneseeq’s laboratories were authenticated by CAP & CLIA and have successfully passed China’s National Center of Clinical Laboratories (NCCL) External Quality Assessment (EQA), College of American Pathologists (CAP) PT, European Molecular Genetics Quality Network (EMQN) PT, and received 3rd party medical laboratory and clinical PCR amplification laboratory qualifications. Geneseeq’s partners included more than 500 colleges and hospitals. Until now, 80+ articles (SCI) analysed by Geneseeq were published. In addition, Geneseeq owned various technology patents. The high-quality and convenient research services were prepared for you.

The high performance computer was consisted of 120 compute nodes, 10 fat nodes and 6 high performance parallel super store. The compute capacity was up tp 98.3 Tflops. Besides, the memory was 27 TB and the total store was 18 PB so as to ensure high-efficiency data processing and secure data store.

全基因组重测序

Whole Genome re-Sequencing,WGS
  • 对已知基因组序列的物种进行基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析
  • 通过序列比对,可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异位点(SV,Structure Variation)位点和拷贝数变异位点(CNV,copy number variation)
  • 可以广泛应用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化、育种品种的研究并提供科学依据

全基因组从头测序

De novo Genome Sequencing
  • 用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱
  • 构建该物种的基因组数据库,为该物种的后基因组学研究搭建平台;为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息
  • 利用新一代高通量Hiseq X-Ten测序技术,可以高效、低成本地完成所有物种的基因组序列图谱

宏基因组测序

Metagenomics Sequencing
  • 对特定环境(或者特定生境)样品中的微生物群体基因组进行高通量测序,解读微生物种群结构、多样性与丰度、基因功能活性、微生物与环境、微生物与宿主相互协作关系
  • 摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具

全外显子测序

Whole Exome Sequencing, WES
  • 利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析
  • 外显子组测序的覆盖度更深,数据准确性更高
  • 外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对研究疾病相关的SNP、Indel等具有较大的优势
  • 基于大量的公共数据库提供的外显子数据,能够结合现有的资源更好地解释研究成果

转录组测序

Transcriptome Sequencing
  • 利用高通量测序技术全面快速地获取某一物种在特定状态下的所有转录本信息
  • 研究基因功能、信号通路、可变剪接和新转录本预测等问题的强大工具,是研究细胞表型和功能的重要手段

长链非编码RNA测序

Long non-coding RNA Sequencing,lncRNA-Seq
  • lncRNA是一类长度大于200nt且无或少有蛋白编码能力的复杂RNA,广泛存在于各种生物体内
  • lncRNA在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用
  • lncRNA测序可以一次性获得样本中几乎全部的mRNA和lncRNA信息,为全面深入研究lncRNA的功能提供了全新的工具

小RNA测序

Small RNA Sequencing
  • 小RNA (Small RNA) 是一类重要的体内调节分子,长度在18-30nt之间,主要包括miRNA、piRNA和siRNA,主要功能是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程
  • 对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量,从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列

环状RNA测序

Circular RNA Sequencing,circRNA-Seq
  • circRNAs(Circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA主要来源于内含子或外显子,在mRNA前体分子可变剪接加工过程中通过反向拼接或套索内含子的方式产生,具有进化上保守、结构稳定以及组织表达特异性等特征。circRNA可以作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)结合胞内miRNA,阻断miRNA对其靶基因的抑制作用
  • Nature、Cell等顶尖期刊发表的研究成果显示circRNA在疾病诊断和治疗方面具有巨大潜力,研究意义重大

全基因组甲基化测序

Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS
  • DNA甲基化对生命活动非常重要,是基因调控的手段之一。DNA的甲基化状态对染色体的结构维持、X染色体失活、基因印记以及胚胎发育、正常细胞功能维持,乃至疾病、癌症发生都是十分重要的
  • 全基因组甲基化测序是将重亚硫酸盐(Bisulfite)处理方法和Illumina高通量测序平台Hiseq X-Ten相结合,对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平的测序
  • 全基因组甲基化可以精确到单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态,从而构建全基因组甲基化图谱
  • 全基因组重亚测序达到全基因组覆盖, 是研究甲基化水平的“金标准”

染色质免疫共沉淀技术

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing,ChIP-Seq
  • ChIP-Seq技术能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段
  • ChIP-Seq通过对不同表型组织内组蛋白、转录因子的靶基因表达水平的差异,揭示差异化表观遗传变异原理